Výpočetní cluster a úložiště Botanického ústavu & MetaCentra

Uživatelské nástroje

Nástroje pro tento web


cs:prace

Rozdíly

Zde můžete vidět rozdíly mezi vybranou verzí a aktuální verzí dané stránky.

Odkaz na výstup diff

Obě strany předchozí revizePředchozí verze
Následující verze
Předchozí verze
cs:prace [2020/06/08 12:41] Vojtěch Zeisekcs:prace [2023/06/27 09:52] (aktuální) Vojtěch Zeisek
Řádek 5: Řádek 5:
 {{ :konsole.png?200|}} {{ :konsole.png?200|}}
  
-> **Základní informace o práci v MetaCentru jsou na [[https://wiki.metacentrum.cz/wiki/Rozcestnik|jeho wiki]].**+:!: **Základní informace o práci v MetaCentru jsou [[https://docs.metacentrum.cz/|jeho dokumentaci]].** Než se pustíte do práce na MetaCentru, přečtěte si dokumentaci a naučte se pracovat v linuxové příkazové řádce. :!:
  
-Na MetaCentru (včetně našeho clusteru) [[https://wiki.metacentrum.cz/wiki/Rozcestnik|se pracuje]] v linuxové příkazové řádce (uživatel se přihlašuje přes SSH), [[https://wiki.metacentrum.cz/wiki/Pruvodce_pro_zacatecniky|noví uživatelé]] se s ní musí seznámit. Uživatel si připraví skript provádějící výpočet, který spustí pomocí příkazu qsub. Chce-li uživatel spustit úlohu explicitně na průhonickém clusteru, musí k příkazu ''qsub'' přidat parametr ''-q ibot'', popřípadě i ''-l cluster=carex'', ''-l cluster=draba'' nebo ''-l cluster=vinca'' nebo jinou specifikaci, kterou lze nastavit [[https://metavo.metacentrum.cz/pbsmon2/qsub_pbspro|v plánovači]]. Např.:+Na MetaCentru (včetně našeho clusteru) [[https://docs.metacentrum.cz/basics/concepts/|se pracuje]] v linuxové příkazové řádce (uživatel [[https://docs.metacentrum.cz/access/log-in/|se přihlašuje]] přes **SSH**), noví uživatelé se s ní musí [[cs:zaklady-prikazove-radky|seznámit]]. Uživatel si připraví skript provádějící výpočet, který spustí pomocí příkazu ''qsub''. 
 + 
 +Chce-li uživatel spustit úlohu explicitně na průhonickém clusteru, musí k příkazu ''qsub'' přidat parametr ''-q ibot'', popřípadě i ''-l cluster=carex'', ''-l cluster=draba'' nebo ''-l cluster=vinca'' nebo jinou specifikaci, kterou lze nastavit [[https://metavo.metacentrum.cz/pbsmon2/qsub_pbspro|v plánovači]]. Např.:
  
 <code bash spusteni_ulohy.sh> <code bash spusteni_ulohy.sh>
Řádek 15: Řádek 17:
 # ...a její spuštění: # ...a její spuštění:
 qsub ... -q ibot ... qsub ... -q ibot ...
-qsub ... -q ibot -l cluster=carex ... +qsub ... -l select=...:cluster=carex -l -q ibot ... 
-qsub ... -q ibot -l cluster=draba ... +qsub ... -l select=...:cluster=draba -l -q ibot ... 
-qsub ... -q ibot -l cluster=vinca ...+qsub ... -l select=...:cluster=vinca -l -q ibot ...
 qsub -l walltime=1:0:0 -q ibot -l select=1:ncpus=4:mem=4gb:scratch_local=1gb -m abe skript.sh qsub -l walltime=1:0:0 -q ibot -l select=1:ncpus=4:mem=4gb:scratch_local=1gb -m abe skript.sh
 </code> </code>
cs/prace.1591620079.txt.gz · Poslední úprava: 2020/06/08 12:41 autor: Vojtěch Zeisek